Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou5f1P20263 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms