Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NelfeP19426 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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