Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NefhP19246 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NefhP19246 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NefhP19246 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NefhP19246 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NefhP19246 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms