Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RargP18911 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RargP18911 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RargP18911 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RargP18911 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms