Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms