Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou4f1P17208 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms