Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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