Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms