Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt8P11679 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms