Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa1P11477 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms