Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PolP10400 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms