Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms