Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CatspereP0DP43 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms