Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf1P09925 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms