Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms