Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04213 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04213 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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