Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01734 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01734 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01734 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01734 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms