Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms