Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AurkcO88445 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms