Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm10509O88255 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms