Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp4O70480 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms