Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn5O54942 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn5O54942 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn5O54942 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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