Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cavin1O54724 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cavin1O54724 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms