Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms