Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Degs1O09005 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Degs1O09005 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Degs1O09005 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms