Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn2O08529 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms