Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp35M0QWN7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp35M0QWN7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp35M0QWN7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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