Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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