Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6871L7N248 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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