Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms