Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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