Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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