Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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