Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms