Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21411J3KMS0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms