Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21897J3KMP5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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