Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms