Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Vmn1r34G3XA52 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Vmn1r34G3XA52 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Vmn1r34G3XA52 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Vmn1r34G3XA52 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Vmn1r34G3XA52 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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