Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3tc1G3X9F6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms