Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3443F7CCV5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms