Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crocc2F6XLV1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms