Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm340F6RGI3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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