Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BC005561E9Q5E2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC005561E9Q5E2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms