Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm20518E9Q548 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20518E9Q548 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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