Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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