Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CenpfE9Q3P4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms