Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms