Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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