Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms