Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms